Bei GoToSocial lässt es sich einstellen, ob Markdown unterstützt werden soll oder nicht.
Das ActivityPub-Protokoll verschickt dann HTML über die Leitung, d.h. es weiß nichts von Markdown.
Das Protokoll wird ja auch von weiteren Diensten verstanden (Friendica, Pixelfed, PeerTube usw.). Falls es eine Affinität zu PHP gibt, wäre Friendica vielleicht auch noch ein Blick wert.