Inc-Datein sind (in meinem Fall) php-Dateien und zwar solche, die (und darum geht es) möglichst nicht separat aufgerufen/ausgeführt werden sollen/dürfen, sondern mittel php-include in eine andere php-datei importiert und nur dort ausgeführt werden sollen.

Dann mach das doch. Das steht zwar im Widerspruch dazu eine Datei doch separat aufrufen zu wollen, wie weiter untem im Therad beschrieben, aber diesen Willen zu opfern wäre das Mittel der Wahl.

PS.: Dann gibt es aber auch noch die Möglichkeit per .htaccess einzelne Dateien zu sperren.